COMPUTATIONAL TOXICOLOGY · 2022 — PRESENT

计算毒理学与科学智能体开发

从单一物质到混合物的毒性预测,从毒性相关性质到报告撰写智能体—— 以毒性为核心的研究作品集。

研究主线 · 以毒性为核心 ONE CORE / FOUR PERSPECTIVES
四个相互关联的研究方向,共同围绕化学品毒性展开。点击各方向可查看项目。
SELECTED RESEARCH · 04

四个科研项目,围绕毒性的四个研究方向

01

可解释深度学习 pKa 预测

GraFpKa

分子图与分子指纹融合表征,结合预训练—微调迁移策略构建酸碱 pKa 预测模型, 通过积分梯度实现原子级贡献解释,完成外部验证与应用域分析。

AttentiveFP Transfer Learning Integrated Gradients
已发表 · JPA 2022 — 2025 查看项目
02

二元混合物毒性预测

Mixture Toxicity

基于 Uni-Mol 与传统分子表征,结合 CA / IA 模型与 rMDR 指数, 构建抗生素与三唑类杀菌剂二元混合物的 pEC50 回归与相互作用判定工作流。

Uni-Mol LightGBM CA / IA / rMDR
已完成 2022 — 2025 查看项目
03

毒性报告撰写多智能体系统

AutoToxReporter

整合 QSAR Toolbox、admetSAR、CTD 与 PubMed 的预测结果与文献证据, 通过大纲规划、分步撰写、反思修订与质量检查的多智能体协作, 生成来源可追溯的毒理学报告。

Multi-Agent LangChain Tool Calling
稿件在审 · J. Cheminformatics 2025 — PRESENT 查看项目
04

条件级亚硝胺致突变性预测

Nitrosamine Ames

已完成 101 个化合物、1,550 条菌株—S9 条件级 Ames 数据集的检索、提取与清洗, 正在探索机制特征表征与条件级建模策略。

Dataset Curation Mechanistic Features QSAR
进行中 · 数据集完成 2026 — PRESENT 查看项目
OUTPUTS · PUBLICATIONS & AWARDS

论文、专著、软著与奖项

2025
In silico prediction of pKa values using explainable deep learning methods
Journal of Pharmaceutical Analysis · 第一作者
已发表
2026
AI 驱动的化学品安全性评估:技术范式、应用进展与未来展望
华东理工大学学报(自然科学版) · 第一作者
已发表
2026
AI-Driven Prediction of Drug ADMET Properties
Springer 专著章节 · 第一作者
在审
2025
GraFpKa 小分子 pKa 预测及可解释性分析软件 V1.0
软件著作权 2025SR0138483
已登记
ABOUT

关于我

杨晨,华东理工大学药物设计学博士研究生(2022 — 2027), 研究方向为计算毒理学与科学智能体开发。本科毕业于西南交通大学制药工程专业(前 5%)。

长期专注于分子性质预测、混合物毒性建模与多智能体系统的交叉研究, 以第一作者发表多篇期刊论文并参与专著与教材撰写。

EDUCATION
华东理工大学 · 药物设计学 · 医学博士
西南交通大学 · 制药工程 · 工学学士
RESEARCH INTERESTS
计算毒理学 · QSAR 建模 · 可解释机器学习
LLM 智能体