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AutoToxReporter: A Multi-Agent System for Multi-Source Chemical Toxicity Evidence Integration and Toxicological Report Generation

在审 Journal of Cheminformatics
第一作者 原始研究

内容简介

化学品毒理学评估需要专家将碎片化的证据综合为来源可追溯的报告。 这一过程耗时且难以规模化,而现有自动化工具大多仅解读单一平台的数据。 本文开发了 AutoToxReporter——一个整合多平台证据并为指定毒性终点生成结构化报告的多智能体系统。 我们在不同工作流配置下评估了该系统,并考察了各组件对报告生成的影响。 在所有测试条件下,AutoToxReporter 生成的报告结构总体完整、证据组织清晰。 对抽样报告的人工评估发现,94.1% 的引文支持其对应陈述。 该系统整合了定量构效关系预测、数据库记录与文献证据, 同时保留了报告陈述与其来源之间的链接。 AutoToxReporter 为多来源毒理学证据整合与面向特定终点的报告生成提供了可复现的框架, 也展示了大语言模型智能体如何在保持来源可追溯性的前提下,支撑证据密集型的毒理学写作。

系统架构

AutoToxReporter · 系统架构MULTI-AGENT WORKFLOW
AutoToxReporter 多智能体架构 输入化学品、毒性终点和语言,多模型生成大纲后由 Integrator 整合,也可提供自定义大纲。Composer 撰写,Reflector 按设置反思修订,Inspector 可选检查,输出带来源的报告。规划与生成阶段调用证据及编辑工具。研究评估比较量规评分、多评委一致性、基线和引文支持情况。 01 / 输入与设置 02 / 大纲规划 03 / 报告生成 04 / 研究评估 化学品标识 CAS / 名称 / SMILES 毒性终点 · 报告语言 自定义大纲(可选) 生成参数 单次 / 分步生成 反思轮数 · M Inspector 开 / 关 Generator 1 Generator 2 Generator N Integrator 可编辑的最终大纲 多模型独立提纲 去重 · 补缺 · 统一结构 Composer 初稿 · Draft Reflector 修订稿 · Draft Inspector(可选) 最终报告 + 引文 反思修订 × M 量规评分 · 五个维度 多评委一致性 基线方法比较 人工引文支持核查 比较设置 生成模式 / 反思轮数 Inspector / 报告语言 离线研究评估,非必经步骤 共享工具 / Function Calling 报告编辑 检索 / 插入 / 替换 / 删除 QSAR Toolbox 性质 / 结构警示 / 实验 admetSAR 3.0 ADMET 性质预测 CTD 基因 / 疾病 / 通路 PubMed 文献摘要与来源
依据研究架构图重绘。多模型大纲规划与报告生成共享工具层;自定义大纲可绕过自动规划。反思轮数与 Inspector 均可配置,最终报告支持来源追溯。右侧为研究中的评估设计,不表示每次生成都执行完整评估。

作者

Yang C, Zhang Z, Fang J, Li W, Liu G, Tang Y.

稿件说明

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